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重症肠病毒的血清型为71，又称为“肠病毒71型”，最早是在1974年于美国发生大流行，临床上它们会产生许多症状，包括手足口病，泡疹性咽峡炎，无菌性脑膜炎，类小儿麻庳症，甚至造成致命的脑炎。肠病毒71型大流行除了在美国之外，也曾经在日本、瑞典、澳洲、和马来西亚爆发过。台湾地区在1998年爆发的肠病毒71型大流行，根据卫生局的统计，在1998年四月到十二月间，共有407例手足口病合并中枢神经症状的个案报告，其中77例死亡。在流行病学的相关性来看，学校和家庭是最常见的流行场所。
根据台南成大医院的分析1998年四月至十二月间97个确定为肠病毒71型感染的病历报告，其中56位为男性，41位为女性，年龄层分布为3个月到12.5岁，87%的个案都小于五岁。以临床表现来区分：79%为手足口病、35%合并中枢神经症状：其中包括肌跃型抽筋〈67%〉、呕吐〈53%〉、肢体活动异常〈35%〉、嗜睡〈21%〉。另外在10个被诊断为神经性肺水肿的个案中，有4例在到达急诊室时已经死亡。根据唯一的解剖报告，最具特征的病理发现是在丘脑、中脑、桥脑、延脑、和脊髓等中枢神经呈现严重的发炎反应，这些组织切片对于肠病毒71型均呈现阳性反应。
肠病毒71型侵犯中枢神经可以出现许多症状，包括：无菌性脑膜炎（脊髓液可见发炎细胞，同时脊髓液细菌培养为阴性反应）、脑炎（意识改变）、类似小儿麻痹症候群（急性肢体无力、肌腱反射降低、肌力降低）、若同时出现脑炎和类似小儿麻痹症候群的症状，就称为脑脊髓炎。
急性肺水肿是肠病毒71型常见的致命原因，有关肺水肿出现的机转，目前以神经性肺水肿的说法为主，当肠病毒71型侵犯中枢神经后，会造成自主神经系统失调的症状：如神经性膀胱、痲痹性肠蠕动丧失、失眠、盗汗、高血糖、白血球增生、心搏过速等等。当自主神经系统失调更进一步造成全身血管收缩时，肺部血流量相对增加，肺水肿、呼吸衰竭、休克就随之而来。