如果病人没有接受适当的治疗就有可能发生治疗失败，甚至产生抗药性肺结核病，进而造成治疗的困扰，一旦发生抗药性结核病医师必须使用更多的药物，病人必须忍受更多的药物副作用，且治疗时间至少要18至24个月，却不一定会治疗好。
在治疗结核病临床经验上常常可见病人不能遵从医师医疗指示而导致治疗失败，譬如说常可见病患服药1-2个月即自行停药当症状复发又再服用药物，或是医师处方三种药物病患自行挑选其中一或二种药物服用，这些都是造成治疗失败的原因； 总括来说， 肺结核病患接受抗结核药物治疗服药服从性不良，不能持之以恒的接受治疗主要的原因有：1治疗时间至少要6个月，治疗时间长且大多数病人在接受药物治疗后一至二个月病情即好转甚至病人自觉痊愈病人失去耐心不继续接受治疗；2、由于必须同时使用多种抗结核药物治疗，药物副作用让病人无法忍受；3、病人没有病识感自认没病不愿接受治疗。
常有人问为什么要治疗这么久的时间，一般肺炎一到两周即可治愈但结核病却至少要6个月，事实上在治疗前两个月病人已近乎痊愈没有症状，且身上的结核菌有近百分之九十活动性最强的结核菌上都已经被杀死，这段期间可以称之为杀菌期，剩下10%细菌残存而这些结核菌因细菌本身生长速度较慢必须要较长的时间（四到七个月）才能将其消灭，这段期间就称之为消毒期；根据医学研究在治疗6到9个月后百分之九十五以上的结核菌可完全被消灭，而剩下近百分之五的细菌不会被杀死，因其近乎不活动故虽然存在病人身上，但并不造成疾病；但如以后发生免疫功能不良状态时结核病就有可能复发。
标准结核病治疗方式采取同时使用三到四种抗结核药物合并治疗，因使用多种化学药物自然会产生一些药物副作用，常见的有皮疹、皮肤痒、肝功能异常、痛风发作，尤其对肝肾功能不良的患者影响不小，但只要能配合医疗的指示并适时回报不良药物反应给医师，医师会适当的调整药物以避免药物副作用所造成的困扰。
结核病已不再是‘白色瘟疫’，得到肺结核不需要害怕只要好好接受正确的治疗 一定会痊愈，人生依然是彩色的。