以前血液制剂未做筛检时，偶而会有病患因输血而感染爱滋病毒，但现在台湾的血液制剂都经过筛检，因此造成感染的机会微乎极微，除非捐血者处在空窗期，也就是捐血者刚被感染，而还没产生抗体的这段期间。另一个血液感染的主要原因是毒瘾患者共用针头或注射液，这是目前台湾因血液感染的最主要原因，也是台湾有关爱滋病防疫的一大隐忧。母子感染又叫垂直感染，是母亲感染爱滋病毒后，因生产或哺乳而传给下一代，虽然数量不多，但因小孩感染爱滋病毒是一个特殊议题，因此仍受到重视。
目前对于爱滋病的治疗，有许多的药物，大致上属于三大类：核甘酸反转录脢抑制剂、非核甘酸反转录脢抑制剂以及蛋白脢抑制剂。这些药物乃针对爱滋病毒的生命周期来作用，可以有效抑制病毒的生长。将上述三类药物作混合性之组合来治疗病人，称为高效能抗爱滋病毒疗法（Highly-active antiretroviral therapy，HAART），也就是俗称的鸡尾酒疗法。根据统计，自从高效能抗爱滋病毒疗法被广泛使用，爱滋病患的住院率以及死亡率皆已大幅下降，表示现有的药物治疗可以有效抑制病毒生长进而提升病患的免疫机能。可惜目前还无法完全将爱滋病毒从病患体内根除，因此病患仍需长期服用药物来控制病情。
根据卫生署疾病管制局的统计，今年至十月底，台湾新发现的爱滋感染病例已达2,849人，较去年一整年新发现之总病例数（1,521人）多了将近一倍。其中大部分为毒瘾患者，较去年多了将近两千人。毒瘾患者是爱滋病毒感染病患成长最快的一个族群，这个族群和其他爱滋患者有所不同，其人格特质和生理上对药物之依赖，可能让此一族群刻意忽略爱滋病的防治，进而造成疾病的散播，这些都值得医学界作进一步的探讨。
爱滋病发现至今已二十多年，在这段期间，医学上有许多的突破和进展，但一般人对此疾病的认识却仍停留在初始阶段。大部分人对此疾病都敬而远之，甚或漠不关心，总认为自己不可能得到此病。由于对此病的陌生，造成许多人不知如何去防范或避免一些危险行为，因而得到此病还茫然不知。从疾病的防治观点，若民众对疾病越了解，就越容易作防治的措施，也就较能控制疾病的扩散。因此一般民众有关爱滋病的教育，是控制爱滋病的重要关键。当人们对爱滋病有正确的认识，就会用比较正面的态度来对待这些患者，这在疾病的治疗上也比较容易达到成功的目标。