目前还未有安全有效的抗病毒制剂上市。照顾病患的原则为多喝水多休息，罹病之第一周内是转为重症之危险期，若孩童为三岁以下，更要特别注意有以下症状，应立即送医：嗜睡、意识不清、活力不佳、手脚无力、无法吞咽、发声、喝水会呛到、持续呕吐未改善、抽搐、厉害咳嗽、心跳很快、脸色苍白、呼吸急促或困难。
静脉注射免疫球蛋白的治疗效果到目前仍有待确认，有零星的报告指出免疫球蛋白有些治疗效果，也有研究发现如果所使用的免疫球蛋白含有高浓度的特定肠病毒抗体，的确可以缩短病毒血症的期间，但是一般的免疫球蛋白是否含有目前流行的特定肠病毒抗体则无法确定。
另有一些药厂发展出可以抑制肠病毒的药物，其作用机制大多是抑制肠病毒对于人类细胞的感染能力，但是这些药物都还在初期的试验阶段，尤其是对于小孩的安全性都还没有经过适当的评估，所以还无法使用。
◎如何避免肠病毒感染
目前肠病毒中，除了小儿麻痹病毒以外，没有疫苗可以预防，并且肠病毒型别很多，无法得过一次就终身免疫，所以勤于正确洗手、保持良好个人卫生习惯，减少被传染的机会是预防肠病毒的基本方法。以下有几点是防疫机关希望民众注意的：
（1）. 高危险群：三岁以下小孩要特别小心，有较高比率得到脑炎、类小儿麻痹症候群或肺水肿；而西元1981年以后出生的人对肠病毒71型都没有抗体，都可能受感染，要特别注意。
（2）. 增强个人之免疫力：注意营养、均衡饮食、适当运动及充足睡眠。
（3）. 加强个人卫生：正确且勤加洗手，以预防自身感染，及避免藉由接触传染给婴幼儿。
（4）. 注意环境卫生：保持环境清洁及通风。
（5）. 避免接触受感染者：避免出入过度拥挤之公共场所，不要与病患（家人或同学）接触。
（6）. 如有疑似肠病毒感染症状请尽速就医。
（7）. 家中有病患时应注意：
(a).小心处理病患之排泄物（粪便、口鼻分泌物），且处理完毕应立即洗手。
(b).多补充水分，学童尽量请假在家休息，以避免传染给同学。
c.对家中之第二个病患要特别小心，其所接受的病毒量往往较高，严重程度可能提高。
◎有下列情况需立刻就医：
（1）. 有嗜睡、意识不清、活力不佳、手脚无力应即早就医，一般神经并发症是在发疹二至四天后出现。
（2）. 肌抽跃（类似受到惊吓的突发性全身肌肉收缩动作）。
（3）. 持续呕吐。
（4）. 持续发烧、活动力降低、烦躁不安、意识变化、昏迷、颈部僵硬、肢体麻痹、抽搐、呼吸急促、全身无力、心跳加快或心律不整等。
◎患者应避免与孕妇、新生儿及小孩接触。