当然广泛性焦虑症需要与其他身体疾患之作详细的鉴别诊断，需要先排除可能造成相同症状的其他疾病，因为疾病本身也可能导致焦虑情绪；此外，他们常常会经验到各种身体方面的不舒服，而且常常以为自己患了各种身体疾病，而到各家医院接受许多不必要的重复检查及药物治疗。以下列列举一些需要鉴别的疾病，提供网友做参考。
1. 内分泌异常：如甲状腺疾患、嗜铬细胞瘤、低血糖、肾上腺功能亢进。
2. 心血管异常：如心脏衰竭、心律不整、肺栓塞。
3. 呼吸系统异常：如COPD、肺炎、过度换气。
4. 代谢异常：维他命B12缺乏、紫质症或其他遗传性代谢疾病。
5. 神经系统异常：头痛、癫痫、肿瘤、前庭功能不良、脑炎。
6. 泌尿生殖系统异常：解尿不正常、性交障碍。
当然广泛性焦虑症也有可能只是尚未发现的身体疾病的表征，例如：紫质症是已知的遗传性代谢异常疾病，患者不能正常生产血色素与肌红蛋白及细胞色素，患者会经常性的全身无力倦怠、情绪化性格、剧烈腹痛等、尿液呈红色等。人体有十亿个基因，光是遗传的变异就有无穷多种排列组合，这当中可供筛检的项目是那么的少，因此广泛性焦虑症有可能是这些无穷多种未知疾病中的一种。
根据第四版诊断与统计手册的说明，广泛性焦虑的诊断准则包括：
1. 针对许多事件或活动（诸如工作或学业成就）过度焦虑及担忧（忧惧的预期），至少六个月的期间病人的担忧期笔不担忧期为长
2. 发现自己很难控制焦虑
3. 焦虑及担忧伴随发生下列六项症状中三项（或三项以上）。注意：在儿童可以只有一项
(1) 容易疲累
(2) 难保持专心或心中一片空白
(3) 不能静只或感觉浮躁或不耐烦
(4) 容易发怒生气
(5) 肌肉紧张
(6) 睡眠障碍（包括入睡困难、难以维持睡眠或因为睡不安宁而对睡眠不满意）
由于这是一个排除性的诊断，因此临床上很容易把别的病误诊为广泛性焦虑症。最常发生混淆的身心疾病是：其他焦虑症（恐慌症、畏惧症、强迫症、创伤后压力疾患）、重度忧郁症、虑病症、成人注意力缺损过动症、身体化疾患、与人格障碍症。