(1)中枢神经作用：一般都是由于安眠药的镇静效果所致，如觉得昏昏欲睡、肌肉无力、身体协调困难等，所以服用安眠药者在尚未完全了解身体对于此药的反应时，在操作需要集中注意力的工作时，千万要特别谨慎。使用高剂效的安眠药，可能会导致前行性失忆，即服药时间点之后的事记不太起来。
另外有些人在长期的慢性使用时，会造成注意力无法集中、记忆力减退，以及大脑认知功能（如判断力）损伤的情形，这也是一般大众最关心的事。但是，若在服药过程中同时加入心理辅导、认知行为治疗、家庭治疗等，将社会心理压力重担减低，并适时调整安眠药物，实际上会长期慢性使用同一种安眠药而造成此种副作用的机率颇低。
(2)意识混乱、失去方向感：这种情况大多发生在老年人身上，也有可能出现某段时期的暂时性失忆。但在临床上并未证实服用安眠药和痴呆症有直接的关系。
(3)奇异的激躁作用：有些先前即曾有攻击性行为，或是不稳定的情绪失控者，在服药后反而出现了暴怒甚至暴力行为、或者有幻觉及欣快感，造成更严重的失眠。这可能是服安眠药后类似醉酒的失控现象(Disinhibition)。
(4)抗胆碱作用：有些病患在服药后，出现轻微的视力模糊、口干等作用。
(5)性功能障碍：病人可能会有性欲降低、勃起不能，或者射精障碍等问题，但是发生的机率并不高。
(6)过敏作用：少数人会对安眠药过敏。
(7)呼吸抑制：以注射等非口服方式用药，若剂量超过安全量可能会造成呼吸停止或抑制。尤其在脑部受伤、肺功能损伤或是过量饮酒的病人，都应在用药后小心观察。
其实，安眠药的副作用不如坊间所传言的那样的严重，而且在门诊医师将剂量调整到适合病人的状况时，副作用都可以减到最低；除非是未依照医嘱自行滥用。