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若要评估子宫内膜异位症最直接的方法为利用腹腔镜检查直接观察症灶，也可以抽血检验血清标记CA125，大多数的病人此血清标记会升高，医师也常利用来作为追踪及预估疾病复发的根据。但是事实上只有40~50%的病人CA-125值会升高，不过在治疗后CA-125若能降至正常值以下通常会有较高的怀孕率。治疗上除了药物疗法有不错的效果，如果因子宫内膜异位症而导致不孕时，可以接受腹腔镜手术将骨盆腔黏连处分离及病灶处烧灼处理，如果没有考虑怀孕的病患，必要时可接受子宫及卵巢输卵管全切除手术一劳永逸的方法处理。

严重的子宫内膜异位症病人的怀孕率降低，但其他程度轻者怀孕率正常。在治疗与子宫内膜异位症有关的不孕症患者时，如果是轻微或初期的子宫内膜异位症病人，接受腹腔镜手术可以增加怀孕机会，必要时再以刺激排卵合并人工受精、礼物婴儿或甚至试管婴儿等技术辅助；严重的子宫内膜异位症例如已有输卵管及卵巢周围组织发炎及纤维化者以接受试管婴儿技术治疗最好。这时药物的治疗帮助不大，同时怕副作用影响胎儿，甚至延后受孕的时间，因为研究显示外科手术后接受试管婴儿的时间间隔与着床和受孕的机会没有明显的关系。但是腹腔镜手术后一年是可能怀孕的黄金时期，否则子宫内膜异位症的复发机率很高。

子宫内膜异位症虽然不是致命性疾病，但所造成女性生活的困扰却很大，如果能够在轻度时期及早发现并治疗可以使其再发机率降低，但如果太晚发现，则纵使经过完全的处置有时候也很难达到满意的结果，对付子宫内膜异位症最重视预防而不是治疗，如有症状应至医院检查才是最好的对策。