肝癌治疗一般以手术切除为主。肝癌在五公分以下用手术切除有较佳的效果，所以手术要成功，必须是早期的肝癌。此外尚有动脉栓塞法、肿瘤酒精注射法，及化学药物疗法等。治疗方法的选择须视病人的个别差异而定。
目前国内肝癌末期病人而可以长期活存下来的，绝大部分是以手术切除的病人，一般说来，正常人肝脏切除后只要留下八分之一，即可维持生命。因此按理说来，手术切除并不会影响生存。但是，肝癌病人中高达85％均合并有肝硬化，换句话说，在一百名肝癌病人中，不到十人可以手术治疗。
肝脏可分为左、右两叶，左小而右大。所以，开刀条件除以有否肝硬化决定外，长在左右叶也是决定因素，一旦长在右侧切除后，剩下的左叶体积较小，如并有肝硬化，生命十分危险；有严重黄疸或腹水也不能开刀，此外，肝功能也是开刀与否考虑的范围。如果肝癌已转移，手术也无济于事。
照这样看来，一百名病人中不到十人可以手术，十人中40％又会复发，足见肝癌预后之坏与恶性的重大了。另外九成无法手术的病人又如何抢救呢？由于肝细胞的营养来自门静脉、肝动脉两个系统，正常细胞四分之三仰赖前者，而癌细胞营养却100％来自后者。因此，利用动脉栓塞疗法由腹股沟或周围血管注射栓塞剂将动脉完全阻塞，不会影响正常肝细胞。但是，动脉栓塞法疼痛难耐，而且癌一旦转移到门静脉或是肝动脉已长出侧枝循环时，都会致使这项治疗功亏一篑，但这也算是没有办法中的办法了。
也有人建议，以肝动脉灌注化学药物治疗，但是，有效者不超过8％，副作用又大，严重影响生活品质，效果并不理想。此外，尚有局部治疗，利用超音波指引注射药物或用雷射电烧。
肝癌的治疗方式有这么多种，至于哪一种才是最好的选择，则是因人而异。请与你的肝胆专科医师好好的讨论研究。