以往在治疗慢性Ｃ型肝炎时，由于病患的复发率高，再加上传统的治疗药物副作用大，病患很容易就放弃继续治疗的意愿，而影响治疗效果，新一代治疗Ｃ肝长效型干扰素PEGASYS，患者仅需一星期打针一次，配合口服抗病毒药剂，在半年的疗程后，超半数的患者可控制病情，不再复发。
彰化秀传医院内科部主任杨基滐表示，Ｃ型肝炎的病毒可分为病毒基因型第一到第六型，其中又以病毒基因型第一型属于较难以治疗且复发率高的病毒，根据台湾慢性Ｃ型肝炎流行病学统计，台湾Ｃ肝患者中，有六成属于病毒基因型第一型，以往在治疗慢性Ｃ型肝炎时，病患复发率高，再加上传统治疗药物副作用大，病患很容易放弃继续治疗的意愿而影响效果。
杨基滐指出，慢性Ｃ型肝炎患者使用短效型干扰素治疗失败，肝炎复发，如改用长效型干扰素，仍有百分之二十机会可获得疗效，但研究显示，仍有一到二成Ｃ型肝炎患者，不论是用短效或长效干扰素，都没有效果。
长效干扰素有别于短效干扰素之处在于，它可在血液中维持一百六十八小时的有效浓度，及稳定的血中浓度，有别于时下其他的干扰素制剂，因此具有更好的疗效及更少的副作用，根据临床试验显示，新药对于不管是病毒基因型第一型的Ｃ型肝炎患者，或是伴随肝硬化的Ｃ型肝炎患者等难以治疗的病患，都具有五成以上的疗效。
杨基滐指出，传统治Ｃ肝的用药是短效型，病人每周要打三剂，外口服抗病毒剂（ribavirin），经过二十四周后才算完成疗程，病人一共要打上七十二剂，而新一代长效型干扰素PEGASYS属长效型药剂，一个星期只要打一次，再加上口服抗病毒剂，完成二十四周的疗程只需打二十四剂即可。
杨基滐说，新药的效果比传统药剂成效提高百分之十至百分之十五，以新旧药治疗结果做比较，完成疗程后追踪六个月效果，传统药物治愈率有四成，六个月以后会随着时间再复发；但新药的治愈率是百分之五十六，六个月后一直追踪到四年，治愈率几乎维持在百分之五十六。
不过，新药的治疗效果虽然比旧药好，但是副作用却是差不多，副作用的比率高达九成，包括：有百分之一至二的病人会引发忧郁症、有类似感冒的症状、发烧、酸痛、体重减轻、掉头发等，但停药以后，这些副作用应会减缓。