第二阶段 牙周手术治疗
在经过5-6星期的牙周基本治疗和口腔卫生训练后，发炎的情况得以适当的控制，但有些患部则无法经由基本治疗加以完全控制，必须藉由牙周手术才能将牙周整袋深层的牙结石和牙菌斑清除干净，并将遭破坏的齿槽骨整形，促使牙周组织愈合，回复健康。
牙周再生手术
牙医师可利用人工骨粉或牙周再生膜等生物材料植入缺损的牙周组织，诱导牙周细胞的再生，并修复受损的齿槽骨，使功能减退的牙齿回复其稳定性及支持力。
第三阶段 牙周维护性治疗
患者经过辛苦漫长的治疗后，牙周病得以获得良好的控制，但牙菌斑随时都在生长，患者除了继续维持良好的口腔卫生习惯外，定期检查和保养是很重要的。
牙齿有些部位牙刷、牙线不容易完全到达将它刷干净，牙菌斑很容易又堆积在这个地方造成牙周病的再复发，所以每隔3-6个月回诊，让牙医师为您作大扫除的工作。
第四阶段 补缀复健治疗在牙周病治疗过程中，有些牙齿因为受损太严重，无法挽救而被拔除，欠缺的齿列会造成口腔机能的障碍，所以需要做假牙或种植值体治疗来恢复口腔的咀嚼发音和美观等。
功能：
假牙可分为固定假牙和活动假牙，固定假牙是利用前、后端的牙齿做桥基，将假牙固定在上面，也就是俗称的牙冠牙桥，因为是利用前、后端的牙齿来承担咬合力量，所以咀嚼功能很好，而且不必拿下来，如果选用近似自然牙颜色的材质，在美观上机可乱真，这是大多数人喜欢固定假牙的原因。如果前、后端任何一端的桥基牙不健康或早已被拔除或其他问题，无法做桥基时，则要考虑做活动假牙，活动假牙的缺牙区无法由两旁的支柱牙来获得充分的支持力，需由无牙区的牙床来承受相当大的咬合力，所以每天需要有一段时间要拿下来，让牙床休息，牙床所承受的力量有限，其咀嚼功能不到真牙的1/2或1/6，有时因设计的关系，金属钩子露出外面，较不美观，病人会比较不能适应。如果实在无法接受活动假牙，则可考虑种植植体治疗，也就是俗称的“植牙”，也就是利用人工牙根种植术为局部获全口无牙的病人做补缀治疗，可是不同缺牙情况做不同的设计，它的缺点是价钱昂贵，治疗时间长，牙医师需要接受完整的训练才能进行合乎标准的治疗。
结论
牙周病形成的主要原因是由于口腔卫生不好造成牙周组织发炎和细菌感染，细菌和它产生的毒素会经由血液循环到达身体其他部位，维和健康，所以养成良好的口腔卫生习惯定期检查和保养是非常重要，当您发现有牙周病时定要请教牙医师为您治疗。