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慢性B型肝炎的治疗，这两种慢性疾病的发作与病毒及宿主之间的细胞免疫系统有极为密切的关系，针对这两种慢性肝炎有许多新的药物相继出现，目前主流的药物为免疫调节剂与抗病毒药物。最近行政院卫生署也核准长效型干扰素用于慢性B型肝炎的治疗，因此医界可用的武器更多了。
全世界B型肝炎的盛行率为5％，而其中约有75％分布在亚洲及大洋洲地区。台湾是B型肝炎的高度流行区域，约有15％到20％的人口带原，且有80％到90％的感染率。B型肝炎带原者发生肝癌的机率，大约是非带原者的150倍。肝癌一直是国人前三大癌症死因，许多人并不知道自己是B肝带原者，加上约30-40%带原者属于慢性肝炎，若不治疗，每年以2-3%的机率进行至肝硬化，再以5-10%的机率进行至肝癌，即所谓“肝炎>肝硬化>肝癌”三部曲，因此积极的治疗是迫切的。可见肝炎对于国人健康影响之巨。
台湾地区B型肝炎自然病程的研究指出，带原率与感染的年龄有关，早期的研究显示，孩童时期来自母亲的垂直感染特别容易形成慢性肝炎，青春期之后的水平感染较能够激起免疫反应，急性肝炎之后也较不容易形成慢性肝炎。
基因学的研究也指出，孩童时期的免疫系统尚未健全，感染B型肝炎之后病毒的基因会崁入肝细胞的基因中，长期潜伏在肝细胞中，使得病毒顺利逃过免疫系统的攻击。青春期后免疫系统开始发挥功能，对于异常的肝细胞产生毒杀作用，此时病毒虽然部份被清除，但是肝脏也损失不少细胞。临床上出现一次又一次的肝炎发作，伴随肝功能异常，少数患者会有轻微黄疸。若病毒被成功地廓清，e抗原会转为阴性。在这个过程中，肝脏因为持续发炎，有部份患者会出现纤维化的瘢痕组织，这种组织长成结节后，就成为肝硬化的病变。廓清期之后，残余在肝细胞基因中的病毒基因仍然会不断制造病毒颗粒，最后常导致肝细胞基因毁损，修补机制若无法及时修复基因，往往使得肝细胞癌化。