一般而言，双氧水的清洁能力较弱，若是生活环境较干净，或眼睛分泌物较少的人，直接置入双氧水，尚能保持镜片的干净与消毒；但是，若本身体质较易污染镜片，生活环境污染严重，或发现只用双氧水系统无法清洗干净者，就应使用清洁液先予以搓洗，再置入双氧水系统中消毒。
同样的情形，也会发生在多功能的药水。一般而言，三合一药水可以适合多数人的需要，但是少数体质较易污染镜片者，就要另购清洁液清洗较为妥当。
其次谈到每周保养，软式隐形眼镜由于材质及电极的关系，很容易吸附泪水中的蛋白质于镜片上，即使每日清洗，也无法去除干净，因此需每周用酵素片来分解紧附于片子上的蛋白质。酵素片有的是动物性，有的是植物性，但是目的都是一样，就是分解并去除附在片子上的蛋白质。
此一步骤确保隐形眼镜不会因蛋白质沉淀，而导致眼部刺激、过敏等症状，可惜的是此一步骤常被配戴隐形眼镜的人所忽略。使用酵素片的正确方法，先以一般每日清洁程序清洁镜片，再以冲洗液或双氧水系统第二剂置于片盒中，然后左、右各放入一颗酵素片，待酵素片发泡溶解后，将镜片置入片盒至少十五分钟，若是积垢严重，可酌予延长时间，但一般不得超过十二小时。
然后将片子以冲洗液冲洗干净后，置入浸泡液中至少四个小时。绝对不能将片子在酵素片清洁后，直接冲洗完就戴上，因为如此做的话，残留在片子中的酵素清洁液会在眼球表面释出，造成眼球表面的伤害，使用时不可不慎。
最后，要提醒各位戴用隐形眼镜者，除了片子的清洁外，镜盒也应用刷子每周刷洗，如此才能确保镜片的清洁与消毒。